Mit der Sonderlinie E (mit dem Hinweis „PM3“ gekennzeichnet) fährt ab der Haltestelle „Stadthalle“ über die Friedrich-Ebert-Allee, Kurfürstenallee, Am Kurpark, Koblenzer Straße und Löbestraße bis zur Haltestelle „Bad Godesberg Bahnhof/Ria-Maternus-Platz“. Anschließend geht es durch die Unterführung Rüngsdorfer Straße zur Haltestelle „Bad Godesberg Bahnhof/Rheinallee“ und weiter über die Rheinallee, Ubierstraße, Mittelstraße und Ludwig-Erhard-Allee auf die BAB 562. Die Busse nehmen die Ausfahrt Bonn-Oberkassel/Beuel-Süd und fahren über den Landgrabenweg und die Oberkasseler Straße zur Haltestelle „Ramersdorf“. Von dort geht es über die Königswinterer Straße, Samansstraße, Gallusstraße, Kirchstraße, Wehrhausweg, Buchenweg, Broichstraße und Maarstraße bis zur finalen Haltestelle „Im Thelenpfand“.
Zurück fährt die „PM3“ ab der Haltestelle „Pützchens Markt, Adelheidisplatz". Von dort nimmt sie die gleiche Route wie auf dem Hinweg bis zum Bonner Hauptbahnhof.
Die letzten garantierten Fahrten der Sonderlinien finden jeweils um 2 Uhr, bzw. 4 Uhr am Samstag- und Sonntagmorgen statt.